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Es el año 195 de la Era de las Colonias. Cinco Mobile Suits de combate, llamados Gundam debido a su diseño basado en el mineral de “Gundamium”, salen de las Colonias con destino a la Tierra. Su misión es realizar una serie de ataques contra la rama militar de la Alianza Terrestre, llamada OZ, y así liberar a las Colonias de su influencia. Los pilotos de los cinco Gundams no se conocen entre sí, ni tienen idea de participar en una misión común. En una primera instancia, se percibirán entre ellos como enemigos.
Haciéndoles frente a los Gundam, está el brazo de OZ, dirigido por el aristócrata y líder militar Treize Kushrenada, y su mano derecha, el misterioso Zechs Merquise.
Pero los ataques de los Gundam también afectan a los civiles en la Tierra y en las Colonias, que no quieren ver guerras desatadas, sino volver a un tiempo de paz. Los pacifistas de la Tierra están apoyados por la familia Darlian, y la hija de éstos, Relena, quienes viajan al espacio a buscar tratados de paz. Las políticas pacifistas están apoyadas mayormente por el Reino de Sanc, aún cuando éste se encuentra bajo influencia de la Alianza, y seguidas en acción militar por varios grupos de resistencia en Asia y Europa.
